中山大学企业管理研究所为了能更加系统和深入地对各相关行业和领域的研究，在所长吴能全教授提出的全面提升本土企业组织能力的全能管理模式基础上，从行业和功能模块两个方面整合内外部资源，成立相应的研究中心并配套研究团队做系统的前沿研究，从而能更好地实现理论和实践的无缝链接和服务我国的本土企业。至今为止，中山大学企业管理研究所已经成立了的模块研究中心包括：营销研究中心、生产运营研究中心、企业大学研究中心、学习与发展研究中心、人力资源研究中心、风险管理与内控研究中心、 组织变革研究中心、领域研究的不断深化和有关条件的成熟，将陆续成立其他功能模块研究中心。